Expresión de miRNAs en plasma de pacientes naive del Occidente de México con infección por el VIH.

Abstract

Los microRNAs o miRNAs son pequeñas cadenas de RNAs no codificantes, de 20 a 25 nucleótidos de longitud, que actúan como reguladores de la expresión de genes mediante la unión de estos a sitios específicos del mRNA, generando así la inhibición de su traducción o su degradación. Estudios realizados con miRNAs procedentes del genoma del hospedero, demuestran que algunos de estos tienen una actividad antiviral en la infección y replicación del VIH. Pocos estudios se han realizado acerca de la expresión de miRNAs en pacientes naive con infección por el VIH, que permitan observar su expresión sin la presión farmacológica. OBJETIVO: Determinar la expresión de miRNAs en pacientes naive del occidente de México con infección por el VIH. MATERIAL Y METODOS: Estudio transversal descriptivo en donde se evaluó la expresión relativa de 84 miRNAs en 13 individuos en dos grupos: 1) grupo control sin infección por el VIH (n=3) y 2) grupo de pacientes naive con infección por el VIH (n=10). Se hizo la extracción de RNA total, síntesis de cDNA y expresión de miRNAs mediante PCR Array Plasma. La PCR en tiempo real se realizó con el kit miScriptSYBR. La normalización de los datos fue llevada cabo con los programas geNorm y RefFinder. La prueba t de Student se usó para examinar la expresión diferencial de miRNAs entre los grupos. Se realizó un nuevo grupo de individuos sanos (Grupo 3; n=10) y se cuantifico al igual que en el grupo 2, la expresión absoluta del miRNA con expresión diferencial. Se usaron dos programas bioinformáticos (miRTarBase y Miranda-mirSVR) para encontrar el/los genes blancos del miRNA expresado diferencialmente y finalmente se cuantificó la proteína PIN1 mediante ELISA. RESULTADOS: Se evaluó la expresión relativa de 84 miRNAs y se identificó a miR-296-5p sub-expresado en el grupo 2 (Fold change=0.065+-0.050), con respecto al grupo control (Fold change=0.694+-0.346). Por lo tanto, se midió la expresión absoluta de éste miRNA por qPCR, confirmando el resultado (p