Aberraciones cromosómicas en pacientes con cáncer colorrectal esporádico mediante su detección por amplificación de sondas dependiente de ligación múltiple

Abstract

El cáncer colorrectal es una enfermedad compleja y heterogénea, por su localización, curso clínico variable, diferencias genéticas, raciales y de estilo de vida. A nivel mundial ocupa el tercer lugar en frecuencia y cuarto lugar como causa de mortalidad. Los mecanismos moleculares involucrados en el origen del cáncer colorrectal son las alteraciones epigenéticas y la inestabilidad genómica, que a su vez se divide en inestabilidad cromosómica e inestabilidad de microsatélites. La inestabilidad cromosómica es causa de la aneuploidía observada en cáncer colorrectal esporádico y familiar. Ocurre en el 70-85% de los casos, ocasiona cambios en el número copias y estructura cromosómica, ocasionando pérdida de la heterocigosidad en genes supresores de tumor y mutaciones en protooncogenes. La amplificación de sondas dependiente de ligación múltiple (MLPA) es una técnica que nos permite el estudiio de las aberraciones cromosómicas, su aplicación en cáncer colorrectal se ha limitado al estudio de las alteraciones cromosómicas estructurales. Las sondas MLPA-subteloméricas no han sido previamente utilizadas para la detección de aberraciones cromosómicas en pacientes diagnosticados con cáncer colorrectal. El objetivo de este estudio es determinar las aberraciones cromosómicas presentes en muestras de pacientes con cáncer colorrectal esporádico mediante el uso de sondas MLPA-subteloméricas y su corroboración con sondas MLPA complementarias en el caso de alteraciones estructurales y sondas FISH de enumeración satelital y locus específicos para las alteraciones numéricas inferidas. Estudiamos 102 muestras de pacientes con CCR esporádico usando por primera vez MLPA sondas subteloméricas. Detectamos ACE tanto por perdida como por ganancia en el 89% de los casos. Las ACE más frecuentes por ganancia estructural fueron la de los cromosomas 7p22 (68.6%), 7q36 (23.5%), 20q13 (20.5%), 20p13 (19.6%), 13q12 (18.6%), 16p13 (15.6%), 1p36 (12.7%), 1q44 (9.8%), 1Dq26 (8.8%), 13q34 (7.8%), 6p25 (6.8%) y Xq28 (5.8%); por delación fueron la de los cromosomas 12q24 (17.6%), 4q35 (11.7%), 3p26 (8.8%), 4p16 (8.8%), 22q13 (8.8%), 2p25 (6.8%), 22q11 (6.8%), 8p23 (5.8%), 18p11 (5.8%) y Xq28 (4.9%). Además, exploramos la capacidad de MLPA sondas subteloméricas para la búsqueda de aneuploidías en CCR esporádico. Aneuploidía fue inferida en el 40% de los casos, las más frecuentes fueron la pérdida del cromosoma 4 (5.8%) y ganancia de los cromosomas 7 (19.6%), 20 (14.7%) y 13 (6.8%). Con estos resultados concluimos que la MLPA sondas subteloméricas es una alternativa de evaluación y de menor costo, que permite detectar las principales alteraciones cromosómicas tanto numéricas como estructurales en muestras de pacientes con CCR esporádico.